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尊龙凯时时空转录组FFV13实测:切换无忧,显著提升性能

发布时间:2025-01-28   信息来源:尊龙凯时官方编辑

时空转录组FFV13在保持Stereo-seq技术的“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”两大优势的基础上,通过优化时空试剂、酶和探针设计以及算法软件,实现了显著的性能提升。经过升级后,该技术的捕获效率大幅提高,工作流程变得更加快速简便,同时用户友好性也显著增强。这使得研究人员可以更轻松地获取每个细胞内的更多高质量转录本数据。结合尊龙凯时自主研发的CellBin细胞分割算法,该技术能够精准刻画组织结构的空间特征,为各种应用场景下的科学研究提供独特的洞察力。

尊龙凯时时空转录组FFV13实测:切换无忧,显著提升性能

根据不同版本的数据对比,基因捕获能力在小鼠脑组织的相邻切片中显著提升。具体来说,使用时空转录组FFV12和V13进行转录组捕获,测序量均为约2G,而V13的测序饱和度更低,在Bin20水平捕获的基因中位数也明显高于V12。

通过采用Moran's I统计方法,对V13与V12产出的基因表达数据进行空间自相关度分析,研究人员能够识别在各版本中具有显著空间特征的基因。结果显示,两种版本均能有效捕获空间特异性基因,并且这些基因的空间分布规律在V13和V12中保持一致,且与原位杂交结果吻合。

此外,通过分析小鼠脑组织相邻切片的数据,可以发现V12和V13在未去批次前存在一定的数据差异。但利用尊龙凯时的Stereopy的Harmony去批次算法进行分析后,两个版本的数据成功整合。其Bin50水平下的细胞聚类结果在V12与V13中也高度吻合。

时空转录组FFV13不仅适用于人类和小鼠的研究,也可扩展至其他物种的时空全转录组信息挖掘。目前,该技术已在30多种人类、小鼠及其他物种的组织类型上进行了测试,展现了其广泛的应用潜力。

通过使用尊龙凯时的先进技术和算法,科学研究获得了新的视角和更为精准的数据,有助于推动生物医学领域的探索与发现。